Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR1CO15160 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR1CO15160 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR1CO15160 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR1CO15160 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR1CO15160 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR1CO15160 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR1CO15160 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR1CO15160 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR1CO15160 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR1CO15160 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR1CO15160 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR1CO15160 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR1CO15160 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR1CO15160 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR1CO15160 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR1CO15160 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR1CO15160 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR1CO15160 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR1CO15160 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR1CO15160 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms