Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNMO15061 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNMO15061 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNMO15061 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNMO15061 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNMO15061 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNMO15061 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNMO15061 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNMO15061 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNMO15061 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNMO15061 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNMO15061 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNMO15061 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNMO15061 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNMO15061 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNMO15061 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNMO15061 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNMO15061 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNMO15061 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNMO15061 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNMO15061 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNMO15061 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNMO15061 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNMO15061 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNMO15061 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYNMO15061 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYNMO15061 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNMO15061 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNMO15061 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNMO15061 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNMO15061 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNMO15061 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNMO15061 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNMO15061 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNMO15061 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNMO15061 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNMO15061 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNMO15061 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNMO15061 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNMO15061 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNMO15061 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNMO15061 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNMO15061 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNMO15061 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNMO15061 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNMO15061 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNMO15061 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNMO15061 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNMO15061 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNMO15061 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNMO15061 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNMO15061 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNMO15061 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNMO15061 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNMO15061 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNMO15061 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNMO15061 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNMO15061 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNMO15061 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNMO15061 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNMO15061 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNMO15061 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNMO15061 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNMO15061 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNMO15061 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNMO15061 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNMO15061 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNMO15061 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNMO15061 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNMO15061 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNMO15061 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNMO15061 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNMO15061 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNMO15061 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNMO15061 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNMO15061 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNMO15061 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNMO15061 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNMO15061 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNMO15061 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNMO15061 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNMO15061 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNMO15061 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNMO15061 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNMO15061 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNMO15061 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNMO15061 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNMO15061 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNMO15061 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNMO15061 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNMO15061 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNMO15061 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNMO15061 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNMO15061 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNMO15061 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNMO15061 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNMO15061 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNMO15061 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNMO15061 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNMO15061 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms