Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHOX2AO14813 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2AO14813 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms