Protein–RNA interactions for Protein: O14525

ASTN1, Astrotactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASTN1O14525 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ASTN1O14525 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASTN1O14525 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms