Protein–RNA interactions for Protein: O00499

BIN1, Myc box-dependent-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN1O00499 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BIN1O00499 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BIN1O00499 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BIN1O00499 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BIN1O00499 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BIN1O00499 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BIN1O00499 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BIN1O00499 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BIN1O00499 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BIN1O00499 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BIN1O00499 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BIN1O00499 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BIN1O00499 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BIN1O00499 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BIN1O00499 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BIN1O00499 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BIN1O00499 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BIN1O00499 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BIN1O00499 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BIN1O00499 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BIN1O00499 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BIN1O00499 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BIN1O00499 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BIN1O00499 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BIN1O00499 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BIN1O00499 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BIN1O00499 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BIN1O00499 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BIN1O00499 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BIN1O00499 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BIN1O00499 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BIN1O00499 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BIN1O00499 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BIN1O00499 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BIN1O00499 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BIN1O00499 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BIN1O00499 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BIN1O00499 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BIN1O00499 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BIN1O00499 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIN1O00499 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIN1O00499 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIN1O00499 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIN1O00499 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIN1O00499 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIN1O00499 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIN1O00499 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIN1O00499 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIN1O00499 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIN1O00499 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BIN1O00499 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIN1O00499 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIN1O00499 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIN1O00499 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BIN1O00499 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIN1O00499 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIN1O00499 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIN1O00499 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIN1O00499 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIN1O00499 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIN1O00499 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIN1O00499 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIN1O00499 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIN1O00499 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIN1O00499 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIN1O00499 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BIN1O00499 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIN1O00499 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIN1O00499 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIN1O00499 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIN1O00499 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIN1O00499 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIN1O00499 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BIN1O00499 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms