Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCER2I3L3R5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCER2I3L3R5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCER2I3L3R5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCER2I3L3R5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCER2I3L3R5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCER2I3L3R5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCER2I3L3R5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCER2I3L3R5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCER2I3L3R5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCER2I3L3R5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCER2I3L3R5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCER2I3L3R5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCER2I3L3R5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCER2I3L3R5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCER2I3L3R5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCER2I3L3R5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCER2I3L3R5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCER2I3L3R5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCER2I3L3R5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms