Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E9PBE3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E9PBE3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E9PBE3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E9PBE3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E9PBE3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E9PBE3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E9PBE3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E9PBE3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
E9PBE3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E9PBE3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E9PBE3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E9PBE3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E9PBE3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E9PBE3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E9PBE3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E9PBE3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E9PBE3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E9PBE3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E9PBE3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E9PBE3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E9PBE3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E9PBE3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E9PBE3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E9PBE3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E9PBE3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E9PBE3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E9PBE3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E9PBE3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E9PBE3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
E9PBE3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
E9PBE3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E9PBE3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E9PBE3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
E9PBE3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E9PBE3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E9PBE3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E9PBE3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E9PBE3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E9PBE3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E9PBE3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E9PBE3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E9PBE3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E9PBE3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E9PBE3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
E9PBE3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E9PBE3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
E9PBE3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E9PBE3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms