Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NEURL1BA8MQ27 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEURL1BA8MQ27 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms