Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTL1A6NKG5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTL1A6NKG5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL1A6NKG5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTL1A6NKG5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTL1A6NKG5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTL1A6NKG5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTL1A6NKG5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RTL1A6NKG5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTL1A6NKG5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTL1A6NKG5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTL1A6NKG5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RTL1A6NKG5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTL1A6NKG5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RTL1A6NKG5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RTL1A6NKG5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms