Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBY3A6NI87 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms