Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L3A6NEY3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L3A6NEY3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms