Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL33A6NCF5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHL33A6NCF5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms