Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM89A2RUT3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms