Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CPM-202ENST00000546373 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC126335.1-201ENST00000568414 510 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 ABCB4-203ENST00000359206 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 WDFY2-201ENST00000298125 9321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 PRICKLE2-AS3-201ENST00000473434 2496 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC138409.1-201ENST00000505001 3598 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 DISP1-201ENST00000284476 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 ZNF2-204ENST00000617923 3885 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AZIN1-202ENST00000347770 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 NLRP3-204ENST00000366497 4318 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 TMEM106A-208ENST00000612339 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 TDRD9-201ENST00000339063 3447 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 LINC01748-205ENST00000635616 2143 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MYO5A-213ENST00000613858 12139 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CCDC113-202ENST00000443128 5110 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MAPK10-343ENST00000641677 2546 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SATB1-204ENST00000417717 4589 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 NR3C2-207ENST00000511528 2967 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 HEATR4-201ENST00000334988 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 ALDH1A1-202ENST00000376939 822 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 HNRNPH1P2-201ENST00000396845 1210 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 FXYD2-206ENST00000532119 562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC023595.1-201ENST00000536216 564 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC115676.1-201ENST00000538416 329 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CENPC-201ENST00000273853 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 TBPL1-201ENST00000237264 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 GPX5-201ENST00000412168 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 FHL2-207ENST00000409177 4881 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 POGK-202ENST00000367876 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SAR1A-205ENST00000373242 5981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 ACSBG1-201ENST00000258873 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 YME1L1-201ENST00000326799 3994 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC090643.1-201ENST00000623600 3100 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MYEF2-202ENST00000324324 10360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 PIEZO2-202ENST00000383408 9718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MACROD2-202ENST00000378058 4025 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MBD3L1-201ENST00000305625 748 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SMARCA2-211ENST00000417599 980 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC092570.2-201ENST00000452117 1143 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 THSD4-AS1-204ENST00000566268 468 ntTSL 4 BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 ZNF561-AS1-208ENST00000592851 782 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 LINC02204-201ENST00000630447 3206 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 ZNF23-202ENST00000358700 2692 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 LINC00294-201ENST00000631190 3306 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 FBXO38-203ENST00000394370 4132 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CNGA2-201ENST00000329903 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 PFKFB1-203ENST00000545676 1591 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CD22-201ENST00000085219 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 COLGALT2-202ENST00000367520 2325 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms