Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD5-AS1Q9Y6J3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms