Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARP3Q9Y6F1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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