Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AUP1Q9Y679 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AUP1Q9Y679 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms