Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y512

SAMM50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMM50Q9Y512 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMM50Q9Y512 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms