Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLF12Q9Y4X4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms