Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPRKBQ9Y3C4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPRKBQ9Y3C4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms