Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP11BQ9Y2G3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP11BQ9Y2G3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms