Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAF8Q9UPN6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms