Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCML1Q9UN30 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms