Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EPDR1Q9UM22 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EPDR1Q9UM22 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms