Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPCAL4Q9UM19 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms