Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HACL1Q9UJ83 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
HACL1Q9UJ83 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms