Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms