Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTNNA3Q9UI47 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms