Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTNAP2Q9UHC6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTNAP2Q9UHC6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms