Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCF2Q9UG63 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCF2Q9UG63 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms