Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS29Q9UBQ0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS29Q9UBQ0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms