Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL9Q9P2J3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms