Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms