Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCHIP1Q9P0W5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms