Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKD2L1Q9P0L9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKD2L1Q9P0L9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms