Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NKIRAS2Q9NYR9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms