Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VNN3Q9NY84 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VNN3Q9NY84 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms