Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPP4R2Q9NY27 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP4R2Q9NY27 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms