Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC39A9Q9NUM3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC39A9Q9NUM3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms