Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOXD4L1Q9NU39 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD4L1Q9NU39 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms