Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM5Q9NQX1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM5Q9NQX1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM5Q9NQX1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM5Q9NQX1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM5Q9NQX1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM5Q9NQX1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM5Q9NQX1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM5Q9NQX1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM5Q9NQX1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM5Q9NQX1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM5Q9NQX1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM5Q9NQX1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM5Q9NQX1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM5Q9NQX1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM5Q9NQX1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM5Q9NQX1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRDM5Q9NQX1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRDM5Q9NQX1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM5Q9NQX1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms