Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FANCFQ9NPI8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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