Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
A4GALTQ9NPC4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms