Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SARS2Q9NP81 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms