Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY9Q9HBG7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY9Q9HBG7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms