Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf49Q9H6J7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf49Q9H6J7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms