Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLMPQ9H6B4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLMPQ9H6B4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms