Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM12Q9H4Q4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms