Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NXF3Q9H4D5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXF3Q9H4D5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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