Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTDSP1Q9GZU7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTDSP1Q9GZU7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms